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3000株水稻基因序列公開發(fā)表

核心提示：近日，3000株水稻基因組測序文章在GigaScience正式發(fā)表，且整套水稻基因序列以可引用形式在該雜志的附屬開放獲取數(shù)據(jù)庫GigaDB中公開。

近日，3000株水稻基因組測序文章在GigaScience正式發(fā)表，且整套水稻基因序列以可引用形式在該雜志的附屬開放獲取數(shù)據(jù)庫GigaDB中公開。

該項目產(chǎn)生的數(shù)據(jù)是目前已公開水稻序列數(shù)據(jù)量的四倍。該成果標(biāo)志著3000株水稻基因組項目**階段的完成，主要由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院、國際水稻研究所以及華大基因合作開展。

由華大基因和生物醫(yī)學(xué)中心共同創(chuàng)辦的GigaScience是一個開放獲取且數(shù)據(jù)公開的大數(shù)據(jù)期刊。"3000株水稻基因組項目"所產(chǎn)出和公開的大量遺傳信息將*終被應(yīng)用到智能育種實踐中。不同植株間存在自然變異，而了解這些不同性狀發(fā)生的遺傳機制，將有助于成功培育出可高度適應(yīng)不同環(huán)境的雜交品種。

據(jù)悉，上述三家單位的合作不僅公開了13.4TB的數(shù)據(jù)資源，而且還收集了每株水稻的種子（存放于國際水稻研究所的水稻基因資源庫中）。儲存這些種子對充分利用這些遺傳信息已知的水稻品種來開發(fā)和驗證*適合不同環(huán)境的雜交株是十分必要的。然而，實現(xiàn)這一目標(biāo)的另一條件是這一信息可以使研究人員和育種專家直接將遺傳信息（基因型）和不同植株的性狀特征（表型）聯(lián)系起來。這需要仔細評估和管理每株水稻的重要農(nóng)業(yè)性狀特征，之后再在可用的基因組序列中與其相應(yīng)的遺傳標(biāo)記相關(guān)聯(lián)。

現(xiàn)代育種實踐延續(xù)至今，通常依據(jù)表觀性狀特征來指導(dǎo)候選植株雜交，并期望雜交后代能夠表現(xiàn)出結(jié)合和改良的預(yù)期性狀，如抗旱、抗病蟲、產(chǎn)量提高和營養(yǎng)價值增加。然而，當(dāng)兩個植株進行雜交后，對應(yīng)的遺傳組成常常使育種學(xué)家的期望落空，因為未知的基因相互作用會限制、修飾或改變所選擇的性狀特征的形成。因此，常常需要試驗、發(fā)現(xiàn)錯誤和多個連續(xù)的育種階段。

**了解一個植物的遺傳組成可以使研究人員鑒定與特定性狀特征相關(guān)聯(lián)的遺傳標(biāo)記，更好地了解不同的基因相互作用是如何影響植物的表型的，從而實現(xiàn)更加準(zhǔn)確、快速的水稻品種培育。

這個過程需要投入大量的精力與人力。因此，這些向全球植物育種學(xué)家和科學(xué)家免費公開的數(shù)據(jù)，將極大地推動水稻的基因型/表型之間關(guān)聯(lián)的研究，同時對加深植物生物學(xué)的理解提供了豐富的資源。

深圳菲特立科技有限公司

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